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Jun 15, 2021 · 知乎，中文互联网高质量的问答社区和创作者聚集的原创内容平台，于 2011 年 1 月正式上线，以「让人们更好的分享知识、经验和见解，找到自己的解答」为品牌使命。知乎凭借认真、专业、友善的社区氛围、独特的产品机制以及结构化和易获得的优质内容，聚集了中文互联网科技、商业、影视 ...
特别是，当你用NCBI的参考序列作为模板和参考序列数据库作为标准来设计引物时，Primer-BLAST可以设计出只扩增某一特定剪接变异体基因的特异引物。 最后建议用oligo6或primer5验证引物自身的特性：发夹结构、引物自身二聚体、错配和引物间二聚体， G的绝对值。
May 23, 2023 · blast啥没blast出来？目前完全没有相似片段可能性很低了，已知物种基本上都可以找到同源的。我觉得大概率是你blast不咋会用，或者物种跑错了，比如跑出来的是污染的微生物的。 如果真的blast不出来，新基因不就出来了嘛这不快乐高分文章送上门？
先确定模板来源菌的拉丁名，在NCBI中确定是否有这个菌的序列，primer-blast时在参数选择里填写对应的菌种名，NCBI中没有序列，选custom，然后直接输入你查询到的模板序列
很多刚接触生物学研究的小伙伴经常会问： 应该如何使用ncbi查询目的基因序列、 怎样进行引物的设计、 如何使用blast进行序列比对？ 等等 针对这些问题，小编收集整理了一系列教程，为科研工作者提供一份相对专业和简明的资料，以作基础参考之用！
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使用Primer-Blast进行比对，首先要输入一对引物序列，并选择序列所属数据库。此时系统将在该数据库中对序列进行查找和对比，并将引物可能结合的位置进行记录，一旦结合位置处于两条链并且产物大小符合要求，系统就会将这种情况列举到结果中。需要注意的是，结合模板的引物不仅是一条正向一 ...
Feb 24, 2016 · 用C++重构的那个版本，蛋白比对速度快了好多倍。 不要直接blastx。你既然是mRNA，那么ORF显然只有一个。
想学生信的医学狗 回复 @遇见哆小啦： 楼主好，我想请教一个问题，我自己提取DNA测序，注释到的基因，想要设计引物看看，用primer-blast验证，出来的结果是这样的，应该是没有找到相应的模板，请问这样的引物序列可以用吗？
